PROSPECCIÓN IN SILICO DE VARIANTES GENÓMICAS ASOCIADAS A LA FERTILIDAD EN EQUUS CABALLUS
DOI:
https://doi.org/10.47820/recima21.v7i1.7155Palabras clave:
equino, fertilidad, genómica.Resumen
La arquitectura genética de las características reproductivas en Equus caballus es intrínsecamente compleja y representa un desafío significativo para la eficiencia y sostenibilidad de la equinocultura. Comprender los mecanismos genéticos subyacentes a la fertilidad es fundamental para el desarrollo de estrategias eficaces de mejoramiento genético. Este estudio tuvo como objetivo realizar una prospección in silico y caracterizar funcionalmente variantes genómicas asociadas a la fertilidad en yeguas y sementales. Para ello, se extrajeron del Horse QTL Database las variantes asociadas a las características de fertilidad en machos y hembras. Tras la selección, todas las variantes fueron sometidas a análisis funcionales en VEP y, posteriormente, a análisis de redes biológicas en GeneMANIA. La metodología in silico empleó el análisis de datos genómicos públicos de secuenciación de nueva generación (NGS), lo que permitió una selección eficiente de Quantitative Trait Loci (QTL) y la identificación de polimorfismos de nucleótido único (Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs) de interés, los cuales fueron posteriormente sometidos a caracterización funcional. En sementales, la prospección reveló la predominancia de variantes intrónicas en genes como DNAH7, KIF16B, MOB3B y NOTCH1, así como variantes downstream_gene_variant en SLC39A10. En yeguas, el análisis identificó la prevalencia de variantes intrónicas en genes como GRAMD1B, SLC6A5, WASHC5, EXOC3L2, RNF17, FGF9, SGCG y RCAN2, además de variantes en regiones regulatorias como upstream_gene_variant (SPATA18, LSM2/HSPA1A), downstream_gene_variant (SH3TC1) y 5_prime_UTR_variant (AMDHD2).
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Referencias
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