PROFILE AND ALLELIC FREQUENCY OF HLA GENES IN THE POPULATION OF ESPÍRITO SANTO’S STATE

Authors

DOI:

https://doi.org/10.47820/recima21.v6i1.6130

Keywords:

Allelic profile, Allele frequency, HLA, NGS

Abstract

The 1990 Human Genome Project was an international public program that sought to map the human genome and understand the functions of each gene. It provided a worldwide incentive for scientific production, resulting in major technological advances in the area of ​​genetic sequencing, driving the evolution of techniques from the Sanger method (1970s) to the Next Generation Sequencing (NGS) currently used. This technique is widely used in HLA genetic typing, a very important piece of information for the success of organ and tissue transplants, especially bone marrow, where compatibility must be almost 100%. This project aims to present the allele frequency and HLA profile of the population of Espírito Santo (ES), obtained through four years of application of the NGS technique in the state of ES. This study analyzed the HLA genetic profile of the population of ES through 10,237 genetic typing reports performed between 2020 and 2024 in the only histocompatibility laboratory in the state. Using NGS data from the TSV (analysis software), allele frequencies were compared to international populations. The most frequent alleles corresponded mainly to European populations and caucasian descendants, with a surprising presence of Asian profiles, despite the low representation of Asian individuals in the state. A significant occurrence of the HLA-B*51:01:01 allele was also observed, associated with the risk of Behçet's disease, indicating the need for further studies to investigate the genetic predisposition to this condition among Espírito Santo residents. The research contributes to local genetic understanding, assisting public health in donation and transplant campaigns.

Downloads

Download data is not yet available.

Author Biographies

  • Suzana Biccas da Silva

    UniSales - Centro Universitário Salesiano.

     

  • Nataly Senna Gerhardt Barraqui

    Doutora em Biologia Vegetal  pela Universidade Federal do Espírito Santo (UFES); Mestra no mesmo programa (UFES); onde atuou com qualidade pós-colheita; estádios de maturação; quimiometria e quimiótipos da espécie Schinus terebinthifolia (aroeira). Graduada em Ciências Biológicas Bacharelado  e Licenciatura no Centro Universitário Salesiano. Docente no Centro Universitário Salesiano (UNISALES)  de Ensino Superior do Cursos de Ciências Biológicas, Biomedicina, Engenharia Civil e Engenharia de Produção. 

  • Priscila Pinto de Souza Klippel

    Licenciada em Ciências Biológicas pela Faculdades Integradas São Pedro – FAESA/ES. Especialista em Qualidade no Serviço de Saúde pela Fundação Educacional Lucas Machado – FELUMA/MG.

  • Márcia Biccas

    Farmacêutica Bioquímica pela Faculdade de Farmácia e Bioquímica do Espírito Santo. Responsável Técnica no LIG Biologia Molecular e Imunogenética.

References

ABBAS, Abul K.; LICHTMAN, Andrew H.; PILLAI, Shiv. Imunologia Celular e Molecular. Tradução: Anderson de Sá Nunes. 10. ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2023. 736 p. Título original: Cellular and molecular immunology. ISBN: 978-85-9515-891-7.

ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DE TRANSPLANTES DE ÓRGÃOS - ABTO. ABTO. São Paulo: ABTO, 2024. Disponível em: https://site.abto.org.br/. Acesso em: 1 jul. 2024.

BELEM, Joice Moraes Faria Monteiro. Avaliação da frequência de HLA-B*51 e seus principais alelos em paciente brasileiros com doença de behçet. Orientador: Alexandre Wagner Silva de Souza. 2019. 92f. Dissertação (Mestrado) - Curso de Ciências Aplicadas em Reumatologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://repositorio.unifesp.br/server/api/core/bitstreams/71fddc74-e2da-4aa1-b71f-80ca550d81c1/content. Acesso em: 3 nov. 2024.

BRASIL. Ministério da Saúde. Resolução da Diretoria Colegiada nº 61, de 1 de dezembro de 2009. Dispõe sobre o funcionamento dos Laboratórios de Histocompatibilidade e Imunogenética que realizam atividades para fins de transplante e dá outras providências. Diário Oficial da União. Brasília, 2 dez. 2009. Disponível em: https://antigo.anvisa.gov.br/documents/10181/2718376/RDC_61_2009_.pdf/37ef8335-a9ab-491b-8763-4b88165620ff. Acesso em: 29 jun. 2024.

COSTA, Pedro Crocamo Ventilari da et al. O Uso da Genômica na Medicina de Precisão: uma revisão narrativa. Revista CPAQV – Centro de Pesquisas Avançadas em Qualidade de Vida, v. 15, n. 3, p. 1-16, 2023. 2178-7514. DOI: https://doi.org/https://DOI.org/10.36692/V15N3-57R. Disponível em: https://revista.cpaqv.org/index.php/CPAQV/article/view/1456/1043. Acesso em: 9 jun. 2024. DOI: https://doi.org/10.36692/V16N1-113R

DADALTO, Maria Cristina; DOTA, Ednelson Mariano. Ciclos econômicos e migração no Espírito Santo do século XIX ao XXI: novos contextos, velhos condicionantes. Revista Ágora, Vitória/ES, v. 34, n. 3, p. e-2023340304, 2023. DOI: 10.47456/e-2023340304. Disponível em: https://periodicos.ufes.br/agora/article/view/40175. Acesso em: 2 nov. 2024.

IBGE - INSTITUTO BRASILEIRO DE GEOGRAFIA E ESTATÍSTICA. Portal Cidades@. [S. l.]. IBGE, 2023. Disponível em: https://cidades.ibge.gov.br/brasil/es/panorama. Acesso em: 1 nov. 2024.

INCA - INSTITUTO NACIONAL DE CÂNCER JOSÉ ALENCAR GOMES DA SILVA. REDOME. Rio de Janeiro: INCA, 2024. Disponível em: https://redome.inca.gov.br/sobre-transplante/transplante-de-medula-ossea/. Acesso em: 16 jun. 2024.

LIG BIOLOGIA MOLECULAR E IMUNOGENÉTICA - LIG. Liglab. Vitória: 4Ps, 2013. Disponível em: http://liglab.com.br/. Acesso em: 1 jul. 2024.

MARINHO, A.; CARDOSO, S. DE S.; ALMEIDA, V. V. DE. Disparidades nas filas para transplantes de órgãos nos estados brasileiros. Cadernos de Saúde Pública, v. 26, n. 4, p. 786–796, abr. 2010. Disponível em: https://www.scielo.br/j/csp/a/xzmVK9gRxGyRqvcVrFs3FfJ/#. Acesso em: 01 jul. 2024. DOI: https://doi.org/10.1590/S0102-311X2010000400020

MEINERZ, C. et al. Avaliação do percentual de compatibilidade HLA entre membros da mesma família para pacientes à espera de transplante de medula óssea em Santa Catarina, Brasil. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, v. 30, n. 5, p. 359–362, set. 2008. Disponível em: https://doi.org/10.1590/S1516-84842008000500006. Acesso em: 14 jun. 2024. DOI: https://doi.org/10.1590/S1516-84842008000500006

MENEZES, Amanda Regina Pinatti. Transplante de Medula Óssea: importância do sistema HLA. Academia de Ciência e Tecnologia, São José do Rio Preto, ano 2019, Semestral. Disponível em: https://www.ciencianews.com.br/arquivos/ACET/IMAGENS/biblioteca-digital/hemoterapia/transplante-medula-ossea/12-Transplante-de-medula-ossea-importancia-do-sistema-HLA.pdf. Acesso em: 10 jun. 2024.

MURPHY, Kenneth. Imunobiologia de Janeway. 8. ed. Tradução: Denise C. Machado, Gaby Renard, Lucien Peroni Gualdi. Porto Alegre: Artmed, 2014. 888 p. Título original: Janeway's immunobiology. ISBN 9780815342434

NACARATO, Nicole Malachias. Sequenciamento de nova geração como ferramenta de detecção de variantes genéticas de origens somáticas e germinativas. Orientador: Dra. Cláudia Aparecida Rainho. 2023. 26f. TCC (Graduação) - Curso de Ciências Biomédicas, Instituto de Biociências de Botucatu, Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho", Botucatu, 2023. Disponível em: https://repositorio.unesp.br/server/api/core/bitstreams/c7bfffdd-e955-4607-a385-f75b0cc882fc/content. Acesso em: 6 jun. 2024.

OBANDO, Mauricio O. Melendez. Importancia de la genealogía aplicada a estudios genéticos en Costa Rica. Rev. biol. trop, San José, v. 52, n. 3, p. 423-450, Set 2004. Disponível em: http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S003477442004000300005&lng=en&nrm=iso. Acesso em: 03 nov. 2024.

OSÓRIO, Maria Regina Borges; ROBINSON, Wanyce Miriam. Genética Humana. 3 ed. Porto Alegre: Artmed, 2013, 783 p.

PORCIONATTO, Marimelia. Dos Projetos Genoma à Covid-19: o papel da ciência aberta e colaborativa. Circumscribere, São Paulo, v. 26, n. Dossiê Ciclo Ciência Viva I, p. 01-07, 23 dez. 2020 DOI: https://doi.org/https://doi.org/10.23925/1980-7651.2020v26;p01-07. Disponível em: https://revistas.pucsp.br/circumhc/article/view/52035. Acesso em: 30 maio 2024. DOI: https://doi.org/10.23925/1980-7651.2020v26;p01-07

ROCHA, C. V. T. et al. Importância da Histocompatibilidade no Sucesso do Transplante de Medula Óssea: uma revisão do sistema HLA. Hematology, Transfusion and Cell Therapy, [s. l.], v. 45, n. 4, p. S531-S532, 18 out. 2023 2531-1379. DOI: https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.htct.2023.09.979. Disponível em: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2531137923011550. Acesso em: 11 jun. 2024. DOI: https://doi.org/10.1016/j.htct.2023.09.979

SILVA, Cristiane Barden et al. Rejeição e Compatibilidade de HLA. Revista Thêma et Scientia, Cascavel/PR: Centro Universitário FAG, ed. 2, ano 2012, n. 2, p. 120-125, 1 dez. 2012. Semestral. Disponível em: https://ojsrevistas.fag.edu.br/index.php/RTES/article/view/508/603. Acesso em: 6 jan. 2025.

SOARES, Jemima Arantes; et al. GENOMA HUMANO: 20 anos do sequenciamento que revolucionou a ciência. Brazilian Journal of Implantology and Health Sciences, [S. l.], v. 5, n. 3, p. 1168–1189, 2023. DOI: 10.36557/2674-8169.2023v5n3p1168-1189. Disponível em: https://bjihs.emnuvens.com.br/bjihs/article/view/353. Acesso em: 1 jun. 2024. DOI: https://doi.org/10.36557/2674-8169.2023v5n3p1168-1189

Published

13/01/2025

How to Cite

PROFILE AND ALLELIC FREQUENCY OF HLA GENES IN THE POPULATION OF ESPÍRITO SANTO’S STATE. (2025). RECIMA21 - Revista Científica Multidisciplinar - ISSN 2675-6218, 6(1), e616130. https://doi.org/10.47820/recima21.v6i1.6130