ANÁLISE DE GENES DIFERENCIALMENTE EXPRESSOS EM AMOSTRAS DE CÂNCER DE MAMA DO SEQUENCE READ ARCHIVE (SRA)
DOI:
https://doi.org/10.47820/recima21.v5i3.4955Palavras-chave:
Perfilação da Expressão Gênica, Biologia Computacional, Neoplasias da Mama, RNA-seqResumo
O câncer/neoplasias de mama (CM) é uma doença altamente incidente em mulheres com milhões de novos casos a cada ano. Dentre os avanços tecnológicos destaca-se a tecnologia de RNA-seq que permitiu compreender melhor a expressão gênica, possibilitando desvendar as interações proteicas entre tumores de mama em estágio inicial e recorrente (pós-mastectomia). Novas ferramentas baseadas em bioinformática surgiram para acompanhar o avanço dos sequenciamentos, e tem-se como principais exemplos as plataformas online de análise Galaxy e WebGestalt. Além disso, foi estabelecido o Sequence Read Archive (SRA) como um repositório público para os dados de sequência de nova geração, assim como foi estabelecido o uso do repositório de dados genômicos funcionais o Gene Expression Omnibus (GEO). Neste trabalho, utilizando análise de sequenciamento de RNA total, foi possível demonstrar comparações generalizadas do CM em um estágio inicial com CM recorrente. Além disso, utilizou-se Ontologia Genética (GO), KEGG e Reactome para avaliar as relações funcionais e vias aprimoradas entre CM em um estágio inicial e CM recorrente pós-mastectomia. Em conclusão, através do desenvolvimento deste estudo foi possível descobrir novos biomarcadores que poderão ser utilizados como futuros alvos terapêuticos, possibilitando um melhor diagnóstico e prognóstico no CM visando à melhoria da sobrevida global das pacientes.
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